Более разумные стратегии анализа данных улучшат лечение бесплодия в будущем.

Умные стратегии анализа данных улучшат лечение бесплодия в будущем
                Пропорции эпителиальных (E) и стромальных (S) клеток различаются в ткани эндометрия между ранней секреторной (ESE) и средней секреторной фазами менструального цикла. Это влияет на профиль экспрессии гена образца ткани эндометрия, используемого в клинических условиях для выбора наилучшего дня переноса эмбрионов при лечении бесплодия. Предоставлено: рисунок М. Сухорушенко

Ученые из Тарту обнаружили простой способ улучшить лечение бесплодия в будущем. Результаты исследования, опубликованные в Human Reproduction, ведущем журнале в этой области, могут быть использованы в точной медицине для учета вариабельности менструального цикла у каждой пациентки. Этот персонализированный подход в первую очередь принесет пользу тем парам, которые испытали повторную неудачу ЭКО.
                                                                                       

В 2017 году в Эстонии было проведено более 2800 процедур экстракорпорального оплодотворения (ЭКО), в результате которых родилось 430 детей, что составляет 3 процента от всех рождений. Низкий 15-процентный успех ЭКО может быть вызван проблемами на нескольких этапах лечения. Одним из таких этапов является имплантация эмбриона, которая знаменует начало беременности. Однако, если эмбрион перенесен в матку не в тот день, даже лучшие зародыши не смогут преодолеть это, что приведет к отрицательному тесту на беременность.

Задача специалиста по лечению бесплодия — рекомендовать наилучшее лечение для каждого пациента. Женское бесплодие может быть вызвано проблемами с восприимчивостью эндометрия (внутренней оболочки матки). В то время как в естественном зачатии развивающийся эмбрион может «сидеть и ждать», пока эндометрий не достигнет максимальной восприимчивости, при лечении ЭКО крайне важно перенести эмбрион в правильный день, чтобы увеличить шансы на беременность. Для оценки восприимчивости эндометрия используются разные методы, наиболее точным из которых является тест, измеряющий паттерны экспрессии различных генов при биопсии эндометрия. Для этого проводится минимально инвазивная биопсия эндометрия в цикле, предшествующем циклу ЭКО в тот день, когда эндометрий предположительно является наиболее восприимчивым. Анализ паттернов экспрессии определенных маркерных генов предоставляет важную информацию для определения того, «правильные ли гены экспрессируются в нужное время». При необходимости время переноса эмбриона регулируется, что является примером точной медицины в лечении бесплодия.

Исследование, опубликованное в Human Reproduction, основано на хорошо известном факте, что внутренняя оболочка матки состоит из нескольких различных типов клеток. Новизна исследования заключается в том, что в предыдущих исследованиях не учитывалось влияние пропорций типов клеток на профили экспрессии генов эндометрия. Этот новый подход делает анализ профиля экспрессии генов более конкретным, что также повышает эффективность тестов на основе паттернов экспрессии генов. Этот документ также был отмечен главным редактором репродукции человека, что означает, что он считается значительным улучшением в этой области.

Это исследование было результатом сотрудничества ученых из Эстонии и Испании и естественным переходом к более ранней работе исследовательской группы в Тарту, которая позволяет повысить эффективность ЭКО. Марина Сухорушенко, первый автор статьи и кандидат наук студент из Института клинической медицины Тартуского университета объясняет: «Общеизвестно, что внутренняя оболочка матки включает клетки разных типов; однако все предыдущие исследования последовательно игнорировали этот факт. Наша работа показывает, как объяснить эту изменчивость в клеточном составе, и, следовательно, значительно повысить точность обнаружения биомаркеров «. В клинических условиях обычно анализируется только профиль экспрессии генов всей ткани, поскольку анализ клеточных фракций по отдельности является трудоемким и дорогостоящим. «Мы разработали конвейер, который позволяет пропустить этот шаг, и вместо этого использует другой подход к анализу данных, чтобы повысить точность без дополнительных затрат», — добавил Сухорушенко.

р. Триин Лайск, научный сотрудник Эстонского центра генома, который координировал анализ данных исследования, добавляет, что смешанный эффект биопсии клеточного состава в прошлом в значительной степени игнорировался, и не только в области репродуктивной медицины. «Принимая это во внимание, мы можем уменьшить количество случайных и ложноположительных результатов и в конечном итоге улучшить наши знания по биологии в различных условиях, а также облегчить обнаружение новых биомаркеров», — сказал доктор Лайск.

Результаты исследования имеют непосредственное практическое значение, и исследовательская группа в настоящее время работает над тем, как интегрировать эти результаты в генетический тест, который используется в клиниках по лечению бесплодия, чтобы выбрать лучший день для переноса эмбрионов. Центр компетенции по технологиям здравоохранения (CCHT), в котором проводилось данное исследование, разработал тест на восприимчивость эндометрия под названием beREADY.

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *