Геномный анализ важен даже для ультра гипермутированных опухолей до иммунотерапии

рак
                Т-клетки-убийцы окружают раковые клетки. Кредит: NIH

Новое исследование Университета Университета штата Огайо — Онкологический госпиталь им. Артура Дж. Джеймса и Научно-исследовательский институт Ричарда Дж. Солова (OSUCCC-James) подчеркивает важность геномного анализа редких злокачественных опухолей, которые генетически нестабильны и имеют большое количество генных мутаций.
                                                                                       

Исследователи OSUCCC-James проанализировали раковые геномы девяти метастатических опухолей и первичную опухоль перед лечением от умершего пациента с редкой формой рака, называемой саркомой дендритных клеток. Заболевание не имеет стандартизированного лечения.

Образцы были получены путем исследования донорства и вскрытия тела. Вскрытие проводили в течение трех часов после смерти, сводя к минимуму посмертные молекулярные изменения.

Анализ показал, что все опухоли были ультра-гипермутантными. То есть раковые клетки имели более 100 генных мутаций на миллион оснований ДНК. Ультра-гипермутационные злокачественные опухоли часто реагируют на иммунотерапию, но рак этого пациента продолжал прогрессировать, несмотря на два курса иммунотерапии и целевые агенты.

Кроме того, исследователи определили шесть субпопуляций злокачественных клеток в образцах опухоли и наличие трех мутационных признаков. Они также классифицировали генетические изменения на те, которые присутствуют во всех, в некоторых или в отдельных опухолях. Они включали точечные мутации в генах-супрессорах опухоли и вероятные мутации драйвера в онкогенах.

Результаты опубликованы в журнале Oncotarget.

«Это исследование иллюстрирует, как особое партнерство с пациентами может способствовать изучению агрессивных редких видов рака», — говорит главный исследователь и соответствующий автор Sameek Roychowdhury, доктор медицинских наук, доцент, профессор медицинской онкологии, точной медицины рака и геномики. «Мы надеемся, что в условиях дальнейшего роста это исследование позволит нам описать сложный ландшафт рака и разработать новые методы лечения на основе этой работы. Мы дали это обещание нашим пациентам и их семьям.

«Полученные данные имеют важное клиническое значение», — добавляет Ройховдхери. «Пациенты с онкологическими заболеваниями с ультра-гипермутацией часто выигрывают от иммунотерапии, но наше исследование показывает, что исследования все еще необходимы для определения того, какой тип иммунотерапии является наилучшим для каждого отдельного пациента».

Для этого исследования было отобрано 24 образца метастатической опухоли из пораженных органов. Компьютерная томография (КТ), взятая до смерти пациента, управляла закупкой образцов опухоли. Секвенирование всего экзома было выполнено на девяти образцах плюс образец предварительной обработки.

На всех 10 участках опухоли наблюдалась частота ультра-гипермутации. Другие ключевые выводы включали:

  • Более 7400 соматических вариантов, выявленных во всех 10 образцах, были классифицированы по трем категориям: обнаружены во всех образцах опухоли, обнаружены в подгруппах образцов и в частных вариантах, уникальных для одного образца опухоли.
  • Опухоль было построено эволюционное дерево, демонстрирующее разнообразие опухолевых клеток.

Молекулы, полученные в результате вскрытия этого пациента, являются одними из первых, опубликованных в Исследовании исследования пожертвования тела для рака в OSUCCC — James. Исследование активно и принимает пациентов направления. Цель состоит в том, чтобы лучше понять агрессивный, устойчивый к лечению рак.

«Пожертвование тела дает нам беспрецедентную способность изучать биологию рака», — говорит Хуэй-Ци Чен, доктор медицинских наук, старший научный сотрудник в области онкологии, который начал исследование с Ройховдхери. «Кроме того, для меня большая честь и честь заботиться о наших пациентах после смерти, и те из нас, кто проводит исследование, стремятся извлечь все возможное из их особого дара и помогать другим».

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *