Исследование обнаруживает 40 новых генетических вариантов, связанных с риском колоректального рака

Колоректальный рак
                Рак — гистопатологическое изображение карциноида толстой кишки. Кредит: Википедия/CC BY-SA 3.0

Наиболее полное на сегодняшний день исследование связи колоректального рака (GWAS), связанное с геномом (GWAS), опубликованное сегодня в Nature Genetics, обнаружило 40 новых генетических вариантов и подтверждено 55 ранее идентифицированных вариантов, которые сигнализируют о повышенный риск рака толстой кишки.
                                                                                       

Исследование, проведенное группой исследователей в Исследовательском центре рака им. Фреда Хатчинсона, также выявило первый редкий защитный вариант для спорадического колоректального рака. Спорадический колоректальный рак не имеет известного семейного синдрома и составляет подавляющее большинство случаев колоректального рака. Вместе эти результаты являются важным шагом на пути к созданию персонализированных стратегий скрининга и лучшей информированности о разработке лекарств от колоректального рака.

«Исследование такого масштаба стало возможным только благодаря сотрудничеству с нашими партнерами из учреждений по всему миру», — сказал доктор Ульрике «Рики» Петерс, заместитель директора Отдела общественных наук в области здравоохранения Фреда Хатча и получатель 40-й работы Фреда Хатча. Юбилейный наделенный стул. «Понимание генетической архитектуры колоректального рака революционизирует наши методы оценки риска и лечения этого заболевания, которое является вторым по степени смертности раком в США». В 2009 году Петерс инициировал и с тех пор возглавлял Консорциум по генетике и эпидемиологии колоректального рака, крупнейшего в мире молекулярно-генетического консорциума по колоректальному раку.

Эти результаты также освещают то, что авторы исследования называют «упущенной возможностью» в разработке лекарств. Исследование выявило несколько локусов, физическое расположение гена в хромосоме, вблизи предполагаемых мишеней для лекарств и генов в путях, которые ранее не были связаны с раком прямой кишки. Авторы считают, что использование результатов GWAS для информирования о разработке лекарств от рака может улучшить показатели успешности разработки лекарств и даже привести к химиопрофилактическим препаратам для людей с высоким риском.

«Существует большой потенциал в использовании результатов GWAS для информирования об обнаружении мишеней для противораковых лекарств. Для таких заболеваний, как диабет 2 типа и болезни сердца, подход GWAS способствует открытию новой биологии и потенциальных мишеней для лекарств», — пояснил доктор Йерун. Хайге, который руководил статистическим генетическим анализом исследования и является штатным ученым в Фред Хатч. «На сегодняшний день поиск новых целей для терапии рака был ограничен, чтобы сосредоточиться, прежде всего, на молекулярных характеристиках раковых клеток. Мы думаем, что есть огромная возможность в использовании подхода GWAS для информирования разработки лекарств от колоректального рака».

В этом исследовании участвовали исследователи из более чем 130 различных учреждений, многие из которых поделились данными и биопрепаратами, которые позволили команде проанализировать геномы более 125 000 человек, из которых было 58 131 случай колоректального рака и 38 296 участников контрольной группы, которые не имели развил болезнь. Количество участников в этом исследовании почти вдвое больше, чем в предыдущих анализах этого типа.

«Крупномасштабные исследования секвенирования всего генома обнаружили миллионы генетических вариантов, которые еще предстоит систематически исследовать на предмет связи с болезнью», — объяснил Хайге. «Наше исследование основывалось на доступности панели Haplotype Reference Consortium, эталонной панели данных о последовательности из более чем 32 000 индивидуумов. Сочетая эту стратегию с специально разработанным чипом генотипирования, мы смогли надежно идентифицировать сигнал ассоциации редкого варианта. и несколько дополнительных сигналов, включающих низкочастотные варианты. «

Предыдущие GWAS для риска колоректального рака рассматривали только общие генетические варианты. Напротив, это исследование включало секвенирование всего генома более чем 2000 человек и было разработано для изучения вклада редких генетических вариантов в риск колоректального рака.

«В этом исследовании мы довели известное количество вариантов риска развития колоректального рака почти до 100», — сказала Табита Харрисон, первый автор исследования и генетический эпидемиолог из Фреда Хатча. «Затем мы расширяем исследуемую группу, включив в нее людей из разных этнических групп. Это даст нам более полное понимание риска для всего населения».

Авторы исследования признают предвзятость в выборке исследования, из которых 91 процент были людьми европейского происхождения.

«Чрезвычайно важно, чтобы мы увеличивали разнообразие в наших будущих исследованиях, потому что преждевременное использование этих результатов для информирования о руководящих принципах скрининга может усугубить существующие расовые различия в скрининге колоректального рака и показателях выживаемости», — предупредил д-р Стефани Бин, общий первый автор исследования и штатный ученый в Фред Хатч.

Генетические варианты происходят из различий в нашей ДНК. Считается, что большинство вариантов являются доброкачественными, некоторые, как известно, связаны с различными заболеваниями, а значение многих других неизвестно. Хотя отдельные генетические варианты оказывают незначительное влияние на риск заболевания, несколько комбинированных вариантов могут стать клинически значимыми, и это может оказать влияние на будущие рекомендации персонализированного скрининга.

«Лица с генетическими рисками в верхнем дециле могут извлечь пользу из более раннего скрининга с помощью колоноскопии», — сказал доктор Ли Хсу, биостатист из Фреда Хатча и ведущий биостатист из консорциума.

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *