Новое генетическое исследование проливает новый свет на риск сердечного приступа

Новое генетическое исследование проливает новый свет на риск сердечного приступа
                Сандра Цинкель, доктор медицинских наук, слева, Кристи Солсбери-Руф и коллеги изучают роль белка в регуляции митохондриальной функции, которая может увеличить риск сердечного приступа. Предоставлено: Университет Вандербильта.

Потеря белка, который регулирует функцию митохондрий, может значительно увеличить риск инфаркта миокарда (сердечный приступ), сообщили ученые Vanderbilt 3 октября в журнале eLife.
                                                                                       

Исследование иллюстрирует, как «интегративная геномика», комбинация фундаментальных исследований, биобанка человека, связанного с электронными медицинскими записями, и новых вычислительно-генетических подходов могут идентифицировать генетически обусловленные изменения в экспрессии генов, которые способствуют развитию сложных заболеваний.

«Это тот тип сквозного исследования, в котором анализируются результаты, полученные в лаборатории, и их перевод в нечто, имеющее важные клинические последствия», — говорит Эрик Гамазон, доктор философии, соавтор исследования с Сандрой Цинкель, доктором медицины. , К.т.н.

Гамазон — специалист по вычислительной генетике и научный руководитель в области медицины в Медицинской школе Университета Вандербильта. Цинкель — доцент кафедры медицины и биологии клетки и развития.

Митохондрии являются энергетическими «электростанциями» клетки. Когда они не работают должным образом, ткани могут нуждаться в энергии. В сердце митохондриальная дисфункция может привести к восприимчивости к сердечному приступу или сердечной недостаточности.

Митохондрии также играют важную роль в профилактике рака. Они усиливают и выполняют апоптоз или запрограммированную гибель клеток, что является способом предотвращения роста аномальных клеток.

«Bid» — это белок, который может вызвать апоптоз, вызванный митохондриями, и, таким образом, является потенциальной мишенью при разработке новых противораковых препаратов. Но что он делает, когда не убивает клетки?

Чтобы выяснить это, Зинкель и его коллеги во главе с аспирантом Кристи Солсбери-Руф выбили ген Bid у мышей и изучили, что происходит с их митохондриями.

«Мы обнаружили, что у этих мышей … в отсутствие Bid были дефекты митохондрий», — сказал Солсбери-Руф. «Никто не показал это раньше.»

При стрессе в их сердцах также были обнаружены признаки повреждения и потери функции, аналогичные тем, которые происходят с людьми, перенесшими сердечный приступ. Детальные исследования показали потерю структур внутри митохондрий, называемых кристами, которые являются критическими для нормальной функции митохондрий.

Это заинтриговало Гамазона, который задавался вопросом, была ли потеря Bid в людях также связана с увеличенной предрасположенностью к сердечному приступу.

Находясь в Чикагском университете, доктор медицинских наук Гамазон и Нэнси Кокс, который в настоящее время руководит Институтом генетики Вандербильта, разработали метод прогнозирования того, может ли экспрессия или уровень активности определенных генов способствовать развитию болезней, столь же разнообразных, как диабет 1 типа, ревматоидный артрит и биполярное расстройство.

Их методика, названная PrediXcan, фокусируется на экспрессии генов, которая переключается вверх или вниз как переключение света генетическими вариациями. Он был разработан с помощью GTEx (Genotype-Tissue Expression), эталонного набора данных Национального института здравоохранения о генетических вариациях и активности генов во многих здоровых тканях.

Исследователи применили модель PrediXcan для прогнозирования экспрессии гена BID в BioVU, банке данных ДНК Вандербильта и в доступных GWAS (общегеномных исследованиях ассоциации) инфаркта миокарда.

BioVU состоит из почти 250 000 образцов ДНК, которые были извлечены из отброшенных образцов крови, сданных пациентами Вандербильта и связанных с их «неопознанными» электронными медицинскими записями, которые были очищены от личной идентификационной информации.

Исследователи определили уровень экспрессии BID в образцах ДНК более чем 29 000 пациентов, из которых более 5000 перенесли сердечный приступ.

Те, у кого был самый низкий уровень BID, в нижних 5 процентах, имели более чем четырехкратный повышенный риск инфаркта миокарда. Более низкая экспрессия BID также была связана с повышенным риском сердечного приступа в дополнительных (не BioVU) образцах GWAS.

Полученные данные свидетельствуют о том, что генотипирование может быть способом выявления пациентов с низкой экспрессией BID, которым грозит сердечный приступ. «Если вы знаете, что кто-то находится в группе риска, вы можете сказать им:» Вы должны быть более осторожными в отношении своего холестерина и артериального давления «, — сказал Зинкель.

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *