Новый инструмент дает более глубокое понимание глиобластомы

глиобластома
                Глиобластома (гистологическая горка). Кредит: Википедия/CC BY-SA 3.0

Исследователи из лаборатории Чарльза Данко в Институте здоровья животных Бейкер разработали новый инструмент для изучения генетических «переключателей», действующих при опухолях глиобластомы, которые стимулируют рост рака. В новой статье в Nature Genetics они определили ключевые переключатели в различных типах опухолей, включая переключатели, связанные с тем, как долго выживает пациент.
                                                                                       

Глиобластома — это агрессивный рак, который формируется в головном или спинном мозге. «Это разрушительное заболевание, и нет хороших вариантов лечения», — сказал ведущий автор книги Tinyi Chu, аспирант лаборатории Данко. Даже когда пациенты проходят лечение, большинство выживают только через 15 месяцев после постановки диагноза.

В новом исследовании группа Данко сотрудничала с коллегами из Государственного университета штата Нью-Йорк, чтобы проанализировать 20 образцов глиобластомы из банка тканей.

«Многие заболевания, в том числе рак, в основном являются дефектами в использовании наших генов, не обязательно в самих генах», — сказал Данко, доцент кафедры биомедицинских наук. Гены составляют только два процента нашего генома. Переключатели, называемые факторами транскрипции, связываются с геномом, чтобы включать и выключать эти гены, что вызывает клеточные изменения, вызывающие заболевание.

Чтобы проанализировать опухоли, исследователи использовали технику под названием ChRO-seq, которая создает карту того, какие переключатели активны и какие гены они включают. Соавтор Hojoong Kwak, доцент кафедры молекулярной биологии и генетики Cornell, первоначально изобрел ChRO-Seq в качестве аспиранта в Cornell University и сотрудничал с группой Данко для разработки нового приложения.

Используя данные ChRO-seq, команда смогла классифицировать глиобластомы по подтипам, основываясь на том, какие конкретные переключатели были активны в разных опухолях по сравнению со здоровыми тканями головного мозга. Они также определили три переключателя, которые будут протестированы в более крупных исследованиях, чтобы определить их способность предсказать, какие пациенты дольше выживут при заболевании, включая два переключателя, чьи соединения ранее были неизвестны.

Чу сейчас анализирует еще большую группу глиобластом, чтобы связать выживаемость пациентов и результаты лечения с активными переключателями в каждой опухоли. Он надеется, что полученные результаты могут послужить основой для персонализированных планов лечения пациентов или помочь в разработке новых методов лечения в будущем.

Новая методика изучает не только рак, но и многие другие заболевания, вызванные нарушениями в регуляции генов, такие как определенные виды сердца или аутоиммунные заболевания. «ChRO-seq дает вам много информации о том, какой переключатель включает опухоль или больную клетку», — сказал Данко. «Это дает вам отправную точку для размышления о том, как вы можете отключить этот выключатель.»/P>

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *