Просеять признаки воспаления для анализа причин болезни Крона

Болезнь Крона
                Микрофотография болезни Крона с большим увеличением. Биопсия пищевода. H & E пятно. Предоставлено: Nephron/Wikipedia.

При изучении болезни Крона, воспалительного расстройства желудочно-кишечного тракта, необходимо отделить потенциальные причины от потока системного воспаления, присущего этому заболеванию. Исследователи во главе с Суброй Кугатасан, доктор медицины, недавно опубликовали анализ, который копает под признаками воспаления, чтобы оценить возможные причины.
                                                                                       

Аспирант Хари Соминени, в лаборатории Кугатасана, объединился с генетиками Эмори и Джорджии, чтобы выработать изощренный подход, который мог бы найти золотые самородки в воспалительном гравии. Результаты были опубликованы в журнале Gastroenterology.

Группа изучила метилирование ДНК в образцах крови педиатрических пациентов с болезнью Крона, как при диагностике, так и после лечения и наблюдения. Информация была получена из образцов крови 164 детей с болезнью Крона и 74 контрольных групп в рамках исследования RISK, которое поддерживается Фондом Крона и Колита и руководителями Кугатасана.

«Наше исследование подчеркнуло, насколько важно выполнять продольное профилирование, смотреть на пациентов до и после лечения, а не просто делать поперечное сечение», — говорит Соминени.

Метилирование ДНК — это динамический процесс, который может влиять на молекулярные фенотипы сложных заболеваний, включая или выключая ген (ы). Исследователи отметили, что нарушенные паттерны метилирования во время диагностики у педиатрических пациентов с болезнью Крона вернулись к тем, кто напоминал контрольных, после лечения воспаления.

Кугатасан — профессор педиатрии и генетики человека Маркуса в Школе медицины и здравоохранения детей Университета Эмори в Атланте и директор Детского центра трансплантации и иммуноопосредованных заболеваний. Соминени учится в аспирантуре по генетике и молекулярной биологии. Степень ожидается в мае 2019 года.

Соавторами являются доктор философии Суреш Венкатесваран, доктор философии Алисия Смит, доктор философии Карен Коннели и доктор философии Дэвид Катлер. в Эмори; и в Технологии Джорджии, доктор философии Грега Гибсона.

Подавляющее большинство связанных с заболеванием изменений метилирования в крови «являются временным следствием воспаления и, следовательно, результатом заболевания», пишут авторы. «То, что мы видим, — это то, что лечение признаков воспаления может в основном лечить симптомы болезни Крона, а не причину». Они добавляют: «Это может, по крайней мере, частично объяснить, почему болезнь Крона часто остается пожизненным ремиттирующим и рецидивирующим заболеванием, несмотря на эффективное лечение симптомов воспаления».

Имейте в виду: образцы взяты из крови пациентов, а не из их кишечника. Поэтому имеет смысл, что гены в белых кровяных клетках в основном дают информацию об уровне системного воспаления, который снижается при успешном лечении. По словам Соминени, взятие образцов из кишечной ткани или из иммунных клеток, расположенных в кишечнике, может дать другой результат.

Исследователи использовали анализ, основанный на «менделевской рандомизации», чтобы определить изменения метилирования, которые могут способствовать или возникать в результате заболевания. Это позволило им убрать воспаление, чтобы выявить изменения метилирования, которые могут лежать в основе развития болезни; эти изменения метилирования, по-видимому, опосредуют генетический риск известного некодирующего варианта (однонуклеотидный полиморфизм или SNP). Интеграция данных метилирования с существующей генетической информацией указывает на ген RPS6KA2, кодирующий рибосомальный белок S6-киназу A2 — ген, который Соминени планирует исследовать далее.

Он добавляет, что анализ был направлен на выявление осложнения, называемого стрингом или сужением кишечника из-за рубцов после воспаления. Во время исследования 14 участников уже имели строгость при постановке диагноза, а 55 прогрессировали до этой формы во время наблюдения. Тем не менее, исследователи пришли к выводу, что метилирование ДНК крови не является предиктором осложнений. Опять же, по словам Соменини, образцы кишечной ткани могут быть разными.

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *