Найдена новая генетическая причина эпилепсии

эпилепсия
                Кредит: CC0 Public Domain

Исследователи из Института Уолтера и Элизы Холл внесли свой вклад в глобальные усилия, продолжающиеся в течение десятилетий, которые выявили две новые генные мутации, которые вызывают редкий тип эпилепсии.
                                                                                       

Исследовательская группа института также проследила одну генетическую мутацию до ее происхождения; человек со спонтанной мутацией, который жил более 5000 лет назад. Команда разработала технологии, которые могут обнаруживать определенные мутации, называемые повторными расширениями, даже в небольших выборочных группах, и инструменты, позволяющие проследить происхождение мутации до ее происхождения.

Открытия были опубликованы в сопутствующих статьях в Nature Communications. Доктор Марк Беннетт, доктор Халум Рафехи и профессор Мелани Бало из Института были частью международного консорциума, в который вошли клиницисты, биоинформатики и биологи из Австралии, Германии, Франции и Нидерландов.

Повторить проблемы

Семейная миоклоническая эпилепсия у взрослых (FAME) — это редкая форма эпилепсии, которая встречается в семьях и обычно начинается в возрасте 20-30 лет. Это вызвано «доминантной» генетической мутацией, означающей, что, хотя это редко встречается в общей популяции, дети затронутых родителей имеют 50/50 шансов унаследовать заболевание. Существует несколько подтипов FAME, называемых FAME1, FAME2, FAME3 и FAME4.

Исследователи института участвовали в международных усилиях, охватывающих два десятилетия, по выявлению генетической причины этих эпилепсий. Теперь исследователи обнаружили мутации — в генах STARD7 и MARCH6 — которые вызывают FAME2 и FAME3 соответственно.

Генетические мутации — это необычный тип, называемый повторными расширениями. Повторные расширения, как правило, связаны с неврологическими заболеваниями, включая болезнь Хантингтона, атаксию, аутизм и FAME.

р. Рафехи сказал, что обнаружение генетической причины этого расстройства может помочь диагностировать пациентов с FAME и другими неврологическими заболеваниями, вызванными повторными расширениями.

«Мы знаем, что генетический диагноз очень важен для пациентов — он дает ответы и позволяет им усовершенствовать варианты планирования семьи и потенциальные методы лечения», — сказал доктор Рафехи.

«И теперь впервые семьи с подозрением на FAME могут быть направлены на тестирование с высокой вероятностью получения окончательного генетического диагноза, изменяющего жизнь».

Загадка, длившаяся десятилетия

Лаборатория Bahlo разработала узкоспециализированные инструменты биоинформатики для выявления повторных расширений, что ставит их на передний план поиска этих редких заболеваний.

р. Беннетт сказал, что исследователи во всем мире потратили более двух десятилетий на поиск генетических мутаций, которые вызвали FAME в семьях из Австралии и всего мира.

«В прошлом году произошел прорыв в определении генетической причины семейной миоклонической эпилепсии у взрослых, когда было обнаружено, что это заболевание вызвано повторным расширением», — сказал доктор Беннетт.

«Обнаружение повторных расширений в ДНК может быть очень трудным. Наша лаборатория разработала инструмент под названием exSTRa (расширенный алгоритм коротких тандемных повторов), который может искать весь геном для повторных расширений, даже с небольшими наборами данных. Это важно, потому что типично методы анализа не могут обнаружить повторные расширения, поэтому их часто игнорируют как причину заболевания. «

Он сказал, что исследовательская группа Института использовала exSTRa для независимой проверки генов, которые были мутированы в этих семьях с помощью FAME.

«Многие из этих пациентов годами — даже поколениями — ждали, чтобы узнать причину своего заболевания. Благодаря этому открытию у них наконец есть ответ», — сказал д-р Беннет.

«Выявление генов, связанных с FAME, является важным шагом в понимании этого заболевания, которое, как мы надеемся, в конечном итоге приведет к улучшению диагностики и лечения пациентов».

Старый вопрос

р. Рафехи разработал программное обеспечение, которое позволило исследователям отследить генетическое генеалогическое древо одной из мутаций, MARCH6.

«Сравнивая последовательность ДНК, расположенную вокруг мутации, мы смогли показать, что все пациенты с подтипом FAME3 имеют одинаковую мутацию MARCH6, что говорит нам о том, что они все являются дальними родственниками», — сказал доктор Рафехи. «Мы также смогли оценить возраст мутации и показали, что FAME3 начинался как единичная, спонтанная мутация у европейского человека 253 поколения — более 5000 лет назад».

р. Рафехи сказал, что оценка возраста генетической мутации — это не просто любопытство, но и ценная информация о болезни и характере ее распространения.

«Это открытие говорит нам о том, что мутации в гене MARCH6 встречаются редко и вряд ли возникнут снова независимо. Это также подтверждает, что FAME3, вероятно, ограничен европейскими популяциями, тогда как другие формы, такие как FAME1, уникальны для Азии. Мы В настоящее время опубликовал веб-сайт, который позволяет исследователям по всему миру использовать наш алгоритм для изучения других генов, представляющих интерес, помогая обнаружить причину и распространение большего количества генетических заболеваний. «/p>

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *