Большое исследование генетических различий выявляет несколько новых целей для целого ряда заболеваний

gene
                Кредит: CC0 Public Domain

Хотя тонкие различия в количестве генов, скопированных у одного человека и переданных следующему, можно обнаружить у многих здоровых людей, их роль в заболевании может быть намного больше, чем считалось ранее.
                                                                                       

Большое многоцентровое исследование, проведенное исследователями из Детской больницы Филадельфии (CHOP), сравнило геномные данные более чем 100 000 человек европейского происхождения и обнаружило, как относительно редкие, хотя и периодически повторяющиеся, генетические вариации могут влиять на различные распространенные заболевания.

Кроме того, существующие лекарственные средства могут быть перенаправлены для борьбы с этими состояниями — от аутоиммунных заболеваний до нейропсихологических заболеваний и даже рака — теперь, когда известны генетические основы этих состояний. Результаты были опубликованы онлайн 14 января 2019 года в журнале Nature Communications.

Изменение числа копий (CNV) — это либо получение, либо потеря геномной информации, и происходит, когда количество копий определенного гена или области генома варьируется от одного человека к другому. Редкие CNVs — это события, которые часто предрасполагают людей к заболеваниям, в то время как более распространенные CNVs обычно хорошо переносятся и распространены у здоровых людей. Тем не менее, есть ранее установленные примеры, в которых CNV могут негативно повлиять на здоровье человека. Фактически, предыдущие исследования предполагают, что они могут оказать широкое влияние на здоровье человека, но большинство из этих исследований были основаны на ограниченных размерах выборки, таким образом, не предоставляя исследователям полную картину их истинного значения.

«Этот анализ дает нам плотную карту влияния редких повторяющихся вариаций числа копий, которые представляют собой важный источник генетических вариаций в нашем геноме, часто предрасполагающих нас, а иногда и вызывающих сложные заболевания», — сказал старший автор Хакон Хаконарсон, доктор медицинских наук, директор Центра прикладной геномики при CHOP. «Наше исследование показало, что предыдущие методы, вероятно, не отражают точную частоту или распространенность регионов с редкими вариациями количества копий, которые напрямую влияют на здоровье человека».

Исследовательская группа генотипировала 100 028 особей из популяций европейского происхождения, используя либо геномные массивы SNP, либо массивы сравнительных геномных гибридизационных платформ. Подавляющее большинство (более 99%) обнаруженных, хотя и редко встречающихся, областей CNV были рецидивирующими, что означает, что они произошли как минимум у двух особей.

Среди этих областей, которые являются наиболее клинически значимыми, есть области с гомозиготными делециями или потеря обоих аллелей или обеих копий гена из одной и той же хромосомной пары. Исследовательская группа определила 375 ранее не зарегистрированных областей, подобных этой. В дополнение к подтверждению связанных с болезнью областей CNV из предыдущих исследований, исследователи обнаружили несколько ранее не зарегистрированных областей, которые соответствуют генам, которые уже представляют клинический интерес, в некоторых случаях, поскольку препараты, которые нацелены на соответствующие пути, могут уже существовать.

Некоторые конкретные области интереса, выявленные в этом исследовании, включают делецию chr7p15.3, связанную с аутоиммунными заболеваниями, поскольку она перекрывается с геном, который кодирует ITGB8a, хорошо известную лекарственную мишень для рака яичников; область гомозиготной делеции, ассоциированная с аутоиммунитетом в chr2q34, которая прерывает кодирующую область гена ERBB4, ключевого онкогена, на который могут воздействовать множественные одобренные FDA низкомолекулярные ингибиторы; и локус chr19p13.3, который кодирует ген HCN2 и может быть потенциальной мишенью для терапии для лечения как эпилепсии, так и боли.

«Число кандидатов в гены, обнаруженных в нашем исследовании, которые требуют дальнейших исследований, устанавливает сильную корреляцию между областями вариаций количества копий и тем, что мы уже знаем о геноме», — сказал Хаконарсон. «Несмотря на то, что продолжающиеся крупномасштабные исследования, посвященные новым открытиям, важны, мы считаем, что дальнейшее параллельное изучение этих вновь выявленных регионов будет по-прежнему давать еще больше клинически значимой информации и ускорить точную медицину».

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *