Эксперты по геномике оспаривают девять генов, связанных с врожденным пороком сердца

Эксперты по геномике оспаривают девять генов, связанных с врожденным заболеванием сердца
                Иллюстрация ЭКГ. Предоставлено: Даррил Лея, NHGRI.

Генетики и кардиологи во всем мире ранее сообщали о 17 генах, вызывающих синдром удлиненного интервала QT, малоизвестное наследственное заболевание сердца. Тем не менее, группа экспертов Clinical Genome Resource (ClinGen) критически переоценила научное доказательство всех 17 зарегистрированных генов, оспаривая девять из этих генов и обнаружив, что только три из генов окончательно связаны с наиболее распространенной формой заболевания. Работа финансировалась Национальным научно-исследовательским институтом генома человека (NHGRI), входящим в состав Национального института здравоохранения.
                                                                                       

ClinGen — это ресурс, финансируемый NHGRI, который определяет клиническую значимость или валидность генов при различных генетических нарушениях для их использования в точной медицине и исследованиях. Девять других генов были классифицированы как имеющие ограниченное или оспариваемое доказательство того, что вызвало синдром. Их результаты были опубликованы в Circulation, рецензируемом журнале Американской кардиологической ассоциации.

Нормальные сердца, ненормальные ритмы

Двадцать лет назад The New York Times опубликовала статью о трех «по-видимому здоровых» молодых людях, которые погибли, казалось бы, загадочными способами во время сна, плавания и после игры в футбол. В 2019 году около 4000 детей и молодых людей умерли в Соединенных Штатах похожими, необычными способами. Очевидной причиной был синдром длинного интервала QT.

Синдром длинного интервала QT вызывается мутациями в генах, которые регулируют электрическую активность сердца. Эти мутации могут вызывать у сердца внезапные, нерегулярные сердечные ритмы или аритмии. Как и в случаях, описанных в статье в New York Times, у людей с синдромом длинного интервала QT могут быть аритмии, которые не спровоцированы или являются результатом стресса и физических упражнений. Но когда возникают аритмии, они могут быть смертельными.

Многие люди с синдромом длинного интервала QT могут не знать, что у них есть такое состояние, если они не получают несвязанную электрокардиограмму, не знают свою семейную историю и не прошли генетическое тестирование. Термин «QT» относится к сегменту электрокардиограммы, который измеряет продолжительность времени, в течение которого сердце расслабляется после сердечного сокращения. При синдроме длинного интервала QT эта длительность ненормально увеличивается и создает уязвимость для опасных аритмий.

С тех пор, как синдром был описан в 1957 году, исследователи занимались генетической гонкой для выявления генов, связанных с синдромом длинного интервала QT, который в настоящее время включает 17 генов.

Используя такую ​​стандартизированную, основанную на фактических данных структуру, международные эксперты ClinGen по синдрому длинного интервала QT смогли классифицировать 17 генов в конкретные группы.

Три гена, KCNQ1, KCNH2 и SCN5A, имели достаточные доказательства, чтобы быть вовлеченными в качестве «окончательных» генетических причин для типичного синдрома длинного QT , У четырех других генов были убедительные или убедительные доказательства, подтверждающие их роль в возникновении атипичных форм синдрома удлиненного интервала QT, присутствующих в период новорожденности с сопутствующей сердечной блокировкой, судорогами или задержками в развитии. Остальные десять генов не имели достаточных доказательств для подтверждения причинной роли в синдроме. На самом деле, девять из этих 10 оставшихся генов были помещены в ограниченной или спорной категории. Авторы исследования предполагают, что эти гены не должны регулярно тестироваться в клинических условиях при оценке пациентов и семей с синдромом длинного интервала QT, потому что у них нет достаточных научных доказательств для того, чтобы вызвать это состояние.

ClinGen как важный ресурс в точной медицине

Провайдеры генетического тестирования используют исследовательские документы, чтобы определить, какие гены включить в свои тестирующие панели для диагностической отчетности перед врачами. Опубликованные документы, в которых сообщается об ассоциациях генных заболеваний, сильно различаются по дизайну исследования и количеству доказательств, подтверждающих их выводы. До недавнего времени не существовало стандартных руководящих принципов, которые могли бы различать гены, найденные с помощью сильных и достоверных научных подходов, и тех, у которых недостаточно доказательств.

NHGRI разработала ресурс ClinGen для решения этой проблемы.

Экспертные группы ClinGen включают исследователей, клиницистов и генетических консультантов, которые применяют основанную на фактических данных структуру при оценке научных данных из исследовательских работ, чтобы поместить генно-болезненные отношения в «окончательные», «сильные», «умеренные», «ограниченные». «оспариваемые» или «опровергаемые» категории.

«ClinGen — это впечатляющее усилие сообщества. Более 1000 исследователей и клиницистов из 30 стран, которые добровольно тратят свое время и опыт, ClinGen обеспечивает столь необходимую ясность для сообщества клинической геномики относительно того, какие пары ген-заболевание имеют достаточные доказательства для клинического использования. «Эрин Рамос, доктор философии, научный сотрудник ClinGen и программный директор Отдела геномной медицины в NHGRI.

Клиническая утилита

«Наше исследование подчеркивает необходимость сделать шаг назад и критически оценить уровень доказательности для всех зарегистрированных ассоциаций генного заболевания, особенно при применении генетического тестирования для наших пациентов. Тестирование генов с недостаточным количеством доказательств в поддержку заболевания причинно-следственная связь только создает риск неправильной интерпретации генетической информации и причинения вреда пациенту «, — говорит Майкл Голлоб, доктор медицинских наук, старший автор статьи и исследователь в Научно-исследовательском институте больницы общего профиля в Торонто.

Кроме того, тестирование на гены, которые не связаны окончательно с синдромом длинного интервала QT, может привести к неуместным и дорогостоящим медицинским вмешательствам, таким как имплантация кардиовертера-дефибриллятора, устройства сердца, которое может исправить опасные аритмии.

Исследователи ClinGen опубликовали аналогичное исследование в 2018 году, посвященное другому заболеванию сердца, которое называется синдром Бругада. В 2019 году Американское общество генетики человека сочло этот документ одним из 10 лучших достижений в области геномной медицины.

Имея более 20 групп экспертов, работающих над различными заболеваниями — рак молочной железы и яичников, глаукома и семейная гиперхолестеринемия и многие другие, — периодическая классификация ряда пар генов-заболеваний направлена ​​на ускорение разработки надежных и полезных генетических тестов с течением времени. ./p>

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *