Первое комплексное исследование вирусной ДНК, обнаруженной в раковых клетках

Первое комплексное исследование вирусной ДНК, обнаруженной в раковых клетках
                Международная группа систематически исследовала ДНК, обнаруженную в более чем 2600 образцах опухолей у пациентов с 38 различными типами рака. Они обнаружили следы вирусов в 13% исследованных образцов, а также дополнительно определили некоторые механизмы, которые вирусы используют для запуска канцерогенных процессов. мутации. Предоставлено: пан-онкологический анализ всего генома.

Исследователи из Университета Восточной Англии помогли провести первое комплексное исследование вирусов, обнаруженных при различных типах рака.
                                                                                       

Международная группа систематически исследовала ДНК, обнаруженную в более чем 2600 образцах опухолей у пациентов с 38 различными типами рака.

Они обнаружили следы вирусов в 13% исследованных образцов, а также определили некоторые механизмы, которые вирусы используют для запуска канцерогенных мутаций.

Результаты были получены после того, как ученые UEA впервые предложили новый способ обнаружения бактерий и вирусов, связанных с раком.

р. Дэниел Брюер из Норвежской медицинской школы UEA и приглашенный работник в Институте Эрлхэма (EI) сказал: «Мы уже знали о некоторых сильных связях между инфекциями и раком. Например, наличие Helicobacter pylori в пищеварительном тракте может привести к язве желудка и связан с раком желудка.

«Между тем, некоторые типы вируса ВПЧ могут вызывать рак шейки матки.

«Человеческая ткань все чаще подвергается секвенированию по всему геному, когда мы переходим в эпоху геномной медицины.

«Когда образцы опухолей секвенированы в целом геноме, ДНК из любых присутствующих патогенов также секвенируется, что позволяет обнаруживать и количественно определять вирусы.

«Это дало нам фантастическую возможность собрать данные, чтобы найти новые ассоциации между вирусами и различными типами рака.

«Впервые было проведено систематическое исследование большинства типов рака для вирусов.

«Это важно, потому что обнаружение новых связей между инфекцией и типами рака может дать вакцины, такие как вакцина против ВПЧ, которые могут снизить глобальное воздействие рака».

На сегодняшний день 11 патогенных микроорганизмов были идентифицированы как вызывающие рак, включая Helicobacter pylori, некоторые типы вируса ВПЧ, гепатит B, гепатит C и вирус Эпштейна-Барр.

Во всем мире 640 000 раковых заболеваний в год вызываются только одним вирусом папилломы человека (ВПЧ), а вакцина должна предотвращать подавляющее большинство случаев рака шейки матки.

В новом исследовании представлен обзор того, какие вирусы играют роль в возникновении рака.

Исследователи также искали вирусы, которые ранее не были связаны с канцерогенезом, или даже те, которые были совершенно неизвестны.

р. Марк Запатка из DKFZ сказал: «Вопрос о том, какие вирусы связаны с раком, очень актуален в медицине, потому что при раковых заболеваниях, связанных с вирусами, возможна реальная профилактика.

«Если выявлен канцерогенный вирус, есть шанс избежать заражения вакциной, чтобы предотвратить развитие рака».

Исследование было проведено Немецким онкологическим исследовательским центром (DKFZ) и является частью Пан-онкологического анализа цельных геномов (PCAWG), консорциума из более чем 1300 исследователей, которые объединились, чтобы установить, какие генетические мутации или паттерны мутации ДНК играют роль в нескольких типах опухолей. Это инициатива, выдвинутая Международным консорциумом по геному рака (ICGC).

Для этого мета-анализа они провели комплексный биоинформационный анализ данных о секвенировании более 2600 геномов опухоли из 38 различных типов рака.

Команда обнаружила следы 23 различных типов вирусов у 356 больных раком. И, как и ожидалось, наиболее распространенными были известные вирусные факторы возникновения и роста опухолей.

Геном вирусов Эпштейна-Барра (EBV), которые, как известно, вызывают ряд различных типов рака (особенно лимфомы, рака желудка и рака носоглотки), был обнаружен в 5,5% исследованных геномов рака. ДНК вируса гепатита В (HBV) была обнаружена в 62 из 330 случаев рака печени.

Команда обнаружила вирусы папилломы человека, чаще всего HPV16, в 19 из 20 случаев рака шейки матки и в 18 из 57 опухолей головы и шеи.

р. Брюэр сказал: «Мы обнаружили, что наличие ВПЧ взаимоисключает некоторые важные изменения, наблюдаемые при раке головы и шеи, что означает, что вирус ВПЧ может помочь развитию рака без дополнительных изменений в его геноме».

Команда также исключила связь между некоторыми вирусами, включая аденовирусы и бакуловирусы, и раком.

В нескольких случаях команда обнаружила другие вирусы, уже известные как вызывающие рак, такие как ретровирус при раке почки. Другие патогены иногда обнаруживались в опухолях того типа ткани, который они обычно заражают, например, цитомегаловирусы при раке желудка.

В некоторых опухолях, связанных с ВПЧ и ВЭБ, исследователи обнаружили, что характерные мутации, которые обычно определяют клетки этих типов рака, отсутствуют. Наличие вируса, по-видимому, поддерживает дегенерацию злокачественных клеток за счет других факторов.

Вирусная интеграция в геном хозяина была признана наиболее важным механизмом, приводящим к мутациям, вызываемым вирусами, особенно вирусами HVB и папилломы.

р. Брюэр сказал: «Мы также обнаружили, что присутствие вируса в опухоли связано с паттерном изменений в геноме, который связан с дефектными механизмами восстановления повреждений ДНК в клетке человека. Это говорит о роли нарушенной противовирусной защиты, поскольку движущая сила при раке шейки матки, мочевого пузыря и головы и шеи. «

Профессор Питер Лихтер из Немецкого онкологического исследовательского центра (DKFZ) сказал: «Анализируя весь геном рака, мы обнаружили следы вирусов в значительно большем количестве опухолей, чем в более ранних исследованиях, которые основывались только на исследовании РНК. Тем не менее, мы не смогли подтвердить распространенное предположение, что другие, пока неизвестные вирусы связаны с раком.

«Однако во многих случаях у нас теперь есть более четкое представление о том, как патогены вызывают злокачественные мутации в клетках».

Исследование финансировалось в Великобритании Фондом по борьбе с раком Боба Чемпиона, компанией Cancer Research UK, Фондом Даллаглио, Масонским благотворительным фондом, Царской семьей и Фондом Харгрейва.

Профессор Дэвид Дирнали из Фонда борьбы с раком Боба Чемпиона сказал: «Это огромное международное совместное предприятие, каталогизирующее вирусные ассоциации рака человека.

«Глубокое секвенирование всего генома из более чем 2600 раковых заболеваний и парных нормальных тканей с использованием надежной методологии, позволяющей избежать» ложного обнаружения «, показало, что около 16 процентов злокачественных новообразований связано с вирусами — выше, чем в предыдущих оценках».

«Известные ассоциации ряда вирусов, например, рака шейки матки, головы и шеи, печени и желудка, были подтверждены, но предполагаемые ассоциации с опухолями головного мозга опровергнуты.

«Исследователи изучили механистические объяснения ассоциаций, показывающие, например, что вирусная интеграция может стимулировать высокую экспрессию теломеразы, которая является туморогенной, и подчеркнули потенциальную важность вирусной интеграции для иммунного ответа.

«Новые вирусные изоляты» хиты «были необычны. Результаты дают важное новое понимание классификации опухолей и дают перспективу для разработки новых стратегий таргетирования рака»./p>

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *