МикроРНК проявляют неожиданную функцию в управлении раком

MicroRNA
                Визуализация микроРНК и мРНК в дифференцирующихся клетках C1C12. Кредит: Райан Джеффс/Википедия

Исследователи долго думали, что только одна нить двухцепочечной микроРНК может заставить гены замолчать. Хотя последние данные оспаривают эту догму, неясно, что делает другая нить и как они могут быть связаны с раком. Новое исследование, проведенное Университетом Томаса Джефферсона, показало, что обе цепи некоторых микроРНК координируют свою деятельность по одним и тем же путям рака, при множественных раковых заболеваниях, чтобы стимулировать агрессивность и рост — два признака плохого прогноза для онкологических больных.
                                                                                       

«Такая координация деятельности действительно удивительна», — говорит старший автор Кристин М. Эйшен, доктор философских наук, профессор и заместитель заведующего кафедрой биологии рака в Джефферсон и со-руководитель программы молекулярной биологии и генетики в онкологический центр Сидни Киммел (SKCC) — Jefferson Health. «Мы знаем, что нити не попадают в одну и ту же последовательность целей. Но, несмотря на это, мы видим, что они работают вместе».

Исследователи не уделяли особого внимания обеим сторонам микроРНК, отчасти потому, что реагенты, созданные для исследования микроРНК, были нацелены только на одну нить, «поэтому в качестве поля мы не рассматривали всю картину», — говорит д-р. . Айшен.

Работа была опубликована в Nature Communications, 20 февраля 2020 года.

Первый автор, доктор философии Рамкришна Митра, научный руководитель в лаборатории доктора Айшена, начал с использования вычислительного подхода, который позволил ему искать обе цепи микроРНК. «Наши данные показали, что одна нить из многих пар не была повреждена, как предполагалось ранее. Мы видели большое количество обеих пар при многих раковых заболеваниях», — говорит доктор Митра.

Глядя на данные 5200 образцов больных раком из 14 типов рака, исследователи обнаружили 26 пар микроРНК, которые выглядели либо более активными и обильными, либо менее активными и обильными при множественном раке.

«Затем мы сузили наш поиск самых больших эффектов», — говорит Айшен. Д-р Митра разработал новый подход к вычислительной биологии, в частности, путем анализа генов, необходимых для выживания и роста раковых клеток в 290 линиях раковых клеток, чтобы определить пути, на которые обе пары микроРНК воздействуют на несколько типов рака. Исследователи также определили, какие пары микроРНК оказали большее влияние на управление или подавление роста рака вместе, чем на одну цепь.

Они нашли две пары, названные miR-30a и miR-145, которые отвечают всем требованиям. «Каждая пара имеет разные гены-мишени, но цели поражают одни и те же пути рака», — говорит доктор Айшен. «Эти микроРНК помогают контролировать рак — как видно из данных пациентов и опухолевых клеточных линий. В результате многие раковые заболевания, такие как почки, легкие, молочные железы, становятся более агрессивными, когда теряют эти микроРНК, и это влияет на выживаемость пациентов». «

Чтобы подтвердить результаты своей вычислительной работы, исследователи воспроизвели то, что они нашли, используя экспериментальный подход. Они вызывали экспрессию miR-145 и miR-30a в клеточных линиях рака легких, что уменьшало агрессивные признаки рака, особенно его рост и миграцию.

«SKCC имеет давнюю историю открытий, связанных с малой функцией РНК при раке, и прорывы доктора Эйшена имеют значительный потенциал для понимания как развития опухоли, так и прогрессирования опухоли», — говорит Карен Кнудсен, доктор философии, исполнительный вице-президент онкологических служб в Jefferson Health, и директор предприятия онкологического центра Сидни Киммела — Jefferson Health, одного из 71 назначенных NCI онкологических центров в США.

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *