Ученые находят много генных «драйверов» рака, но предупреждают: не игнорируйте «пассажиров»

dna
                Кредит: CC0 Public Domain

Массивный анализ полных геномов 2658 человек с 38 различными типами рака выявил мутации в 179 генах и регуляторах генов как «движущие силы» — вариации в последовательностях ДНК, которые приводят к развитию рака.
                                                                                       

Работа является частью проекта «Пан-онкологический анализ целых геномов» (PCAWG), одного из самых всеобъемлющих исследований геномики рака на сегодняшний день, в котором участвуют ученые из 17 стран и более 30 статей, в том числе несколько работ, написанных в Йельском факультете. несколько журналов в начале этого месяца.

Хотя на долю водителей приходился большой процент проанализированных случаев рака, они не объяснили все. Некоторые ученые, в том числе Йельский Марк Герштейн, теперь считают, что для получения более панорамного представления о прогрессировании рака им нужно уделять больше внимания не только классическим генетическим факторам, но и «пассажирам» — тысячам мутаций, не связанных с драйверами, которые составляют Подавляющее большинство мутаций наблюдается в типичном геноме рака. Исторически сложилось мнение, что они не играют никакой роли в росте опухоли.

«Многие из этих мутаций могут иметь небольшие индивидуальные эффекты, но заметный кумулятивный эффект, на развитие рака», — сказал Герштейн, профессор биомедицинской информатики Альберта Л. Уильямса; профессор молекулярной биофизики и биохимии, информатики, статистики и данных; и старший автор статьи в Cell, опубликованной 20 февраля, в которой описывается роль пассажиров в развитии рака.

Понимание генетических корней того, как раковые клетки образуются из здоровых клеток, размножаются и мигрируют в разные органы, и как этот процесс варьируется между типами опухолей и между людьми, имеет решающее значение для разработки новых стратегий борьбы с раком, одной из основных причин смерть во всем мире.

Герштейн, Сушант Кумар, научный сотрудник лаборатории Герштейна, и его коллеги решили рассмотреть роль «пассажиров» в развитии рака. В статье в Cell они сообщают об экспериментах, призванных показать, могут ли мутации пассажиров помочь объяснить 10% случаев рака, в которых исследователи обнаружили мало или вообще не имеют четких генетических факторов. Они обнаружили, что подгруппа пассажиров оказывает существенное влияние на области генома — часто такое же влияние, что и водители, — и в совокупности может оказывать заметное влияние на рост опухоли.

Йельская команда также провела целенаправленный статистический анализ восьми различных типов рака, выявляя совокупное влияние пассажиров на развитие этих видов рака, помимо того, что могли объяснить только водители. В целом, их анализ показал дополнительный 9% вклад пассажиров в прогнозирование того, действительно ли данный образец был злокачественным.

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *