Мощная технология секвенирования проливает свет на эпидемию ВИЧ-инфекции Д.С.

HIV
                Микроскопическое изображение ВИЧ-инфицированной Т-клетки. Кредит: NIAID

Несмотря на значительный прогресс в борьбе с ВИЧ/СПИДом, столица страны все еще борется с эпидемией ВИЧ, причем показатели в пять раз выше, чем в среднем по стране. Недавнее исследование, проведенное исследователями Школы общественного здравоохранения Института Милкена в Университете Джорджа Вашингтона, использует мощную технологию секвенирования следующего поколения, чтобы узнать больше о том, как вирус распространяется и развивает лекарственную устойчивость в округе Колумбия.
                                                                                       

Исследователи из Института вычислительной биологии (CBI) GW получили образцы крови от 68 человек, живущих с ВИЧ в округе, в сотрудничестве с группой DC. Они секвенировали генетический материал, взятый из вируса, и обнаружили, что ВИЧ у D.C. очень разнообразен — это означает, что в местной популяции много разных штаммов. Авторы предполагают, что это разнообразие обусловлено тем, что Д.С. является международным центром с большим количеством временных жителей и посетителей.

Исследователи также обнаружили, что около половины участников исследования имели по крайней мере один лекарственно-устойчивый штамм ВИЧ. Эта информация может быть использована для предоставления целевых, более эффективных лекарств людям с устойчивым ВИЧ.

«Наши выводы о генетически разнообразной и сложной эпидемии ВИЧ в Д.С. имеют научное значение», — сказала Кейли М. Гибсон, которая недавно защитила диссертацию в GW и была ведущим автором исследования. «В то же время, это исследование позволило нам вернуть Округу и сообществу через общественное здравоохранение и сотрудничество с такими организациями, как DC Cohort».

Различные подтипы ВИЧ наиболее распространены в разных частях света. Подтип B наиболее распространен в Северной Америке и Европе. Знание того, какие подтипы распространены в определенном географическом местоположении, помогает врачам определить наиболее эффективное лечение для отдельных пациентов.

«В идеале мы хотим, чтобы врачи знали, что могут циркулировать различные лекарственно-устойчивые мутации, и они могут встретить то, что они не привыкли видеть или не очень распространены», — сказал доктор Гибсон. «Эти знания могут побудить их назначать разные лекарства или, по крайней мере, быть открытыми для идеи о том, что пациенту может потребоваться другая комбинация лекарств, основанная на профилях устойчивых к лекарствам мутаций в разных подтипах».

Исследование было проведено группой ученых-биоинформатиков и эпидемиологов, в которую вошли доктор Гибсон и Маркос Перес-Лосада, доцент в CBI. Используя технологию секвенирования следующего поколения вместе с эпидемиологическими данными, команда смогла составить карту того, как различные штаммы ВИЧ передаются в округе. По словам авторов, узнав больше о факторах, участвующих в таких сетях, можно предотвратить возникновение новых случаев и обеспечить эффективное лечение уже зараженных.

«Наши выводы дают нам важные подсказки о распространении, разнообразии и развитии ВИЧ в Вашингтоне, округ Колумбия», — сказал доктор Перес-Лосада. «Такие знания могут быть использованы для разработки более эффективных методов профилактики и лечения ВИЧ».

Исследование было опубликовано в выпуске Scientific Reports от 6 февраля, онлайнового журнала открытого доступа от издателей Nature ./p>

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *