Краудсорсинговый суперкомпьютерный проект нацелился на коронавирус

covid-19
                Кредит: CC0 Public Domain

Люди во всем мире изолируют себя, чтобы помочь замедлить распространение COVID-19. Но есть и другой способ, позволяющий тем, кто живет в своем доме, но подключен к сети, присоединиться к борьбе с новым коронавирусом. Среди исследовательских программ, участвующих в разработке методов лечения и вакцин для этого нового пандемического вируса, — один из крупнейших в мире краудсорсинговых суперкомпьютерных проектов.
                                                                                       

Во главе с вычислительным биофизиком Грегом Боуманом, доцентом биохимии и молекулярной биофизики в Медицинской школе Вашингтонского университета в Сент-Луисе, проект называется Folding @ home. Он опирается на коллективную мощь домашних компьютеров добровольцев для выполнения сложных расчетов, необходимых для моделирования динамики белка.

Волонтеры со всего мира могут установить программное обеспечение, которое выполняет эти вычисления, когда компьютер в противном случае бездействует. Часто побуждаемые личным опытом работы с различными заболеваниями, участники выбирают область, в которую они могут внести вклад, такие как активизация исследований рака, профилактика болезни Альцгеймера или — теперь — борьба с новым коронавирусом.

Например, Боуман и его команда пытаются понять структуру остроконечного белка COVID-19, который вирус использует для заражения клеток. Такое исследование может выявить способы блокирования белка и, следовательно, инфекции. Со времени объявления в конце февраля нового акцента проекта на коронавирус, число добровольцев Folding @ home резко возросло, и около 400 000 новых папок присоединились к проекту, сказал Боуман.


        Показан первый взгляд на моделирование проекта спайдинга белка COVID-19 проекта Folding @ home. Три цвета представляют компоненты белка шипа; это белок, который новый коронавирус использует для заражения клеток. Сайт, где белок связывается с клетками человека, чтобы заразить их, находится на вершине белка. Используя Folding @ home, исследователи стремятся составить точную картину того, что происходит во время заражения. Понимание этих деталей может помочь выявить способы блокирования вируса от заражения клеток. Предоставлено: Грег Боуман и Максвелл Циммерман

«Реакция до сих пор была ошеломляющей и замечательной, но всегда можно сделать более полезную науку», — сказал он. «Понимание всех различных форм, которые белок шипа может принимать по мере того, как его молекулы отскакивают и сдвигаются, может привести к разработке новых лекарств, которые могут его блокировать, не давая вирусу заражать больше клеток. Мы продолжаем как можно быстрее расширять наши исследования. как мы можем. «

Боумен поделился тем, что можно представить как первый проблеск движущегося белка шипа COVID-19. Он состоит из трех разных белков, которые соединяются вместе, как трехмерная головоломка. При моделировании обнаруживается карман, который помогает вирусу связываться с клетками человека и заражать их.

В духе открытой науки и быстрого обмена новыми знаниями о COVID-19 Боуман сказал, что исследовательская группа опубликует результаты исследований на бесплатных препринтах и ​​сайтах с открытым доступом, таких как bioRxiv./p>

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *