Обнаружение слабости лейкемии, используя технологию CRISPR всего генома

Обнаружение слабости лейкемии с использованием технологии CRISPR всего генома
                Исследователи Калифорнийского университета в Сан-Диего использовали технологию CRISPR для проведения скрининга по всему геному в клетках лейкемии, чтобы блокировать тысячи генов одновременно. Инструмент использовался для идентификации генов, которые питают рост лейкемии, как те клетки лейкоза (зеленые), изображенные растущими в костном мозге. Предоставлено: UC San Diego Health Sciences

Команда исследователей из Медицинского факультета Калифорнийского университета в Сан-Диего и онкологического центра Мурса использовала технологию CRISPR для определения основных регуляторов агрессивного хронического миелолейкоза, типа рака, который по-прежнему трудно поддается лечению и характеризуется частым рецидивом.
                                                                                       

«Мы использовали технологию CRISPR, чтобы провести общий геномный анализ в клетках лейкемии, чтобы блокировать тысячи генов одновременно. Это чрезвычайно мощный инструмент, который позволил нам идентифицировать множество генов, которые способствуют росту лейкемии, и найти новые уязвимости на это может быть нацелено это заболевание «, — говорит старший автор Танништха Рейя, доктор философии, профессор кафедры фармакологии и медицины. «Исследование также показывает, впервые, что скрининг на основе всего генома на основе CRISPR может на самом деле проводиться гораздо более физиологически приемлемым способом: с использованием первичных раковых клеток и в условиях естественной микросреды»./р>

Сообщая в онлайн-выпуске журнала Nature Cancer от 20 апреля 2020 года, Reya и коллеги определили РНК-связывающие белки, которые обычно контролируют, как, когда и если клетки производят определенные белки, в качестве ключа класс белков, которые поддерживают и защищают лекарственно-устойчивые лейкозные стволовые клетки. Авторы сосредоточились на Staufen2 (Stau2), относительно недостаточно изученном члене семейства РНК-связывающих белков, о котором ранее было известно только, что он контролирует развитие мозга и нервной системы.

Эта работа была выполнена в сотрудничестве со следователями Калифорнийского университета в Сан-Диего Джином Йео, доктором философии, и Анжаной Рао, доктором философии, и проводилась ведущим автором Дживишей Баджадж, доктором философии, в то время как она была аспирант в Калифорнийском университете в Сан-Диего в лаборатории Рея. Впоследствии Бахадж поступил в Медицинский центр Университета Рочестера в качестве доцента биомедицинской генетики и научного сотрудника в Институте рака Уилмота.

Команда разработала модель мыши, в которой Stau2 была генетически удалена, и обнаружила, что потеря этого белка привела к значительному снижению роста и размножения лейкемии, и заметно улучшила общую выживаемость на моделях мыши. Stau2 также требовался для продолжения роста образцов первичной ткани пациентов с лейкемией, что указывает на консервативную зависимость при заболевании человека.

«Мы особенно взволнованы этой работой, потому что, насколько нам известно, это первая демонстрация того, что Staufen2 является ключевой зависимостью при любом раке», — сказала Рейя, которая является членом онкологического центра Мурса и Санфордского консорциума по регенерации. Медицина.

Чтобы понять, как Stau2 контролирует рак, исследователи предприняли вычислительный анализ своих целей в масштабах генома с помощью RNA-Seq и eCLIP-Seq. Это привело к открытию того, что этот белок контролирует ключевые онкогены, такие как Ras, и эпигенетические регуляторы, такие как семейство белков LSD/KDM, которые являются критическими лекарственными мишенями, тестируемыми на лейкемию и другие виды рака.

По данным Национального института рака, примерно 1,5 процента мужчин и женщин будут диагностированы с лейкемией в какой-то момент в течение их жизни. В то время как хронический миелоидный лейкоз (ХМЛ) можно контролировать с помощью целенаправленной терапии, это заболевание может быть смертельным, если оно прогрессирует или диагностируется в острой фазе «взрыва». Полученные данные также имеют значение для острого миелоидного лейкоза (ОМЛ) и других видов рака крови.

«Эта работа будет особенно важна для открытия новых методов лечения», — сказал Баджадж. «Наш общегеномный скрининг выявил клеточные сигналы, важные для роста рака, и в будущем это исследование будет полезно для изучения микроокружения, области вокруг опухоли, которая включает ткани, кровеносные сосуды и важные молекулярные сигналы, связанные с тем, как рак ведет себя. «

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *