Исследование показывает, что R-петли координируются с SOX2 при регулировании перепрограммирования на плюрипотентность.

genetics
Кредит: CC0 Public Domain

R-петли — это уникальные структуры в клетке, состоящие из гибридов РНК-ДНК и смещенной одноцепочечной ДНК, которые обычно встречаются вокруг транскрибируемых генов. Однако R-петли также являются динамическими и широко распространенными объектами, которые играют неясную регуляторную и эпигенетическую роль в геноме.

Недавнее исследование, опубликованное онлайн в Science Advances и исследователями из Института биомедицины и здравоохранения Гуанчжоу (GIBH) Академии наук Китая, пролило свет на активность R- петли в перепрограммировании соматических клеток в индуцированные плюрипотентные стволовые клетки (ИПСК). Они обнаружили, что R-петли влияют на перепрограммирование соматических клеток в ИПСК, а нарушение этой активности приводит к дефектам в перепрограммировании соматических клеток в ИПСК.

R-петли могут действовать как эпигенетические маркеры, изменяя связывание фактора транскрипции, модификации хроматина и метилирование ДНК. Исследователи картировали ландшафт R-петель во время OSKM (Oct4, Sox2, Klf4 и c-Myc, четыре транскрипционных фактора в коктейле перепрограммирования), опосредованного перепрограммирования соматических клеток, и показали динамическую связь между образованием и растворением R-петли и процессом перепрограммирования соматических клеток.

«Наши данные указывают на то, что R-петли вызывают резкие изменения как на ранних, так и на поздних стадиях перепрограммирования, но они имеют кратковременные и тонкие изменения на промежуточной стадии, что показывает сходную картину с раскрытием хроматина, метилированием ДНК и геном выражение во время перепрограммирования, «сказал Яо Хунцзе, автор этого исследования из GIBH.

YAO и его коллеги обнаружили, что некоторые R-петли сформировались до экспрессии генов, что позволяет предположить, что R-петли являются генами, готовыми к транскрипции. Их исследование показало, что транскрипционный фактор Sox2 (но не какой-либо другой фактор Yamanaka в коктейле перепрограммирования) был тесно вовлечен в формирование комплекса с R-петлями.

«Это не только транскрипционный фактор, который индуцирует транскрипцию, но также и важный регулятор, который поддерживает баланс R-петель и дополнительно способствует перепрограммированию вместе с факторами, разрешающими R-петли», — сказал YAO./p>

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *