Иммунные свойства древней ДНК, обнаруженные в изолированных деревнях, могут принести пользу человечеству сегодня.

DNA
Кредит: Pixabay/CC0 Public Domain

Могут ли остатки ДНК из вымершего ныне подвида человека, известного как денисовцы, помочь повысить иммунные функции современных людей?

Международное исследование под руководством Исследовательского института трансляционной геномики (TGen), филиала City of Hope и опубликованное в научном журнале PLOS Genetics, представляет первые характеристики генов в ДНК здоровых людей из географически и генетически различных групп населения Индонезии.

Ученые изучили геномное разнообразие среди 116 особей из трех индонезийских популяций: ментавай на западном побережье Суматры; Сумба в центральной Индонезии; и Коровай, группа охотников-собирателей с западной стороны острова Новая Гвинея.

Коровай представляют особый интерес, поскольку их ДНК содержит последние оставшиеся в мире значимые остатки генетического кода — до 5% — от двоюродного брата современных людей, называемого денисовцами, говорится в исследовании. Как и более известные неандертальцы Европы, денисовцы в Азии также являются вымершим человеческим подвидом, который жил десятки тысяч лет назад. И точно так же, как неандертальцы передали определенные иммунные свойства европейским предкам, денисовцы, возможно, передали защитные иммунные гены своим потомкам из Юго-Восточной Азии.

«Усилия по секвенированию генома были в основном сосредоточены на популяциях европейского происхождения», — сказал доктор Хейни Натри, научный сотрудник TGen и один из ведущих авторов исследования. «Большая часть мира глубоко изучена. По мере того, как мы вступаем в эпоху персонализированной и геномной медицины, чрезвычайно важно понять, как генетика ведет к риску заболеваний среди различных групп населения».

Зачем изучать Индонезию?

Распространенный на более чем 17 000 островов между материковой Азией и Австралией, Индонезия является крупнейшим в мире архипелагом. Географически равный США или Европе, 273 миллиона жителей Индонезии делают ее четвертой по численности населения страной в мире после Китая, Индии и США. И все же Индонезия была в значительной степени исключена из бума секвенирования геномики в последнее десятилетие, и там ранее не проводился анализ разнообразия в регуляции генов ни в Индонезии, ни в других островных государствах Юго-Восточной Азии.

«Это отсутствие информации из Индонезии вызывает тревогу, поскольку является эпицентром разнообразия инфекционных заболеваний, таких как малярия и другие новые тропические болезни», — сказал д-р Натри. «Иммунное давление от инфекционных заболеваний является причиной одних из самых сильных избирательных сил на человека на протяжении всей эволюционной истории нашего вида, и Индонезия предлагает уникальные преимущества для изучения реакции на эти заболевания».

Из-за островной среды Индонезии, ее многочисленных изолированных деревень и относительно низкой плотности населения на большинстве почти 6000 населенных островов, исследование показывает, что генетическое разнообразие среди тех, кто живет на каждом острове и даже в каждой деревне, низкое, но также и высокое генетическое разнообразие людей от острова к острову, «что делает его почти уникальной системой изучения для изучения взаимодействия генов с окружающей средой», говорится в исследовании.

Ученые концентрируются на иммунных свойствах древней ДНК человека

р. Николас Банович, доцент кафедры геномики интегрированного рака TGen, генетик-человек и старший автор этой статьи PLOS Genetics, сказал, что результаты исследования выделяют гены, вовлеченные в функцию иммунных клеток. Это предполагает потенциально адаптивную реакцию на местные нагрузки на окружающую среду, включая нагрузки от различных тропических болезней.

«Одним из уникальных аспектов Индонезии является то, что люди на острове Новая Гвинея имеют большие остатки ДНК от одного из наших вымерших предков, денисовцев», — сказал д-р Банович. «Мы обнаружили, что эти остатки древней ДНК приводят к изменениям в генах, участвующих в иммунной функции. Это исследование демонстрирует силу включения недостаточно изученных популяций в стремление улучшить общее понимание генетики человека».

Международная команда продолжает свое исследование, объединяя больше генетических данных, исследуя закономерности местного происхождения и то, как архаичные гены человека внедряются в современную популяцию.

«В настоящее время мы пытаемся точно определить индивидуальные генетические изменения, в частности, те, которые переносятся в этих остатках ДНК-фрагментов из денисованов, — которые регулируют, насколько или мало включен ген, и как эти генетические изменения могут формировать иммунный ответ «, сказал доктор Натри.

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *