Биолог использует базу данных генома для исследования раковых клеток

Биолог использует базу данных генома для исследования раковых клеток
Исследователи из Университета штата Флорида вносят свой вклад в энциклопедию элементов ДНК — проект, позволяющий лучше понять, как работает геном человека. Предоставлено: Национальные институты здоровья.

Профессор биологических наук Университета штата Флорида Дэвид Гилберт использует последние сведения о геноме человека в качестве руководства для лучшего понимания рака.

Гилберт и его коллеги из бывшего СССР были частью команды, которая сравнивала различные типы раковых клеток с базой данных нормальных человеческих клеток, используя разработанный им новый метод, который может идентифицировать тип клеток, из которых происходят раковые клетки. Сравнивая различные раковые клетки с коллекцией нормальных клеток, они смогли определить, какие раковые заболевания в основном близко соответствуют различным типам клеток.

«Раковые клетки происходят из клетки вашего тела, но они изменились», — сказал Гилберт. «Знание того, из какого типа клеток они произошли, особенно важно при оценке того, является ли новая опухоль у рецидивирующего пациента производной от исходной опухоли или это новый рак».

Их работа, опубликованная в Nature Communications, является дополнением к большой серии публикаций, полученных в результате международных усилий по пониманию того, как работает геном человека, финансируемых Национальными институтами здравоохранения, и называется Энциклопедия элементов ДНК (ЭНКОД). Поскольку только 1 процент ДНК человека кодирует любые известные белки, понимание функции остальной части нашего генома было огромной проблемой.

Гилберт и его коллеги также являются авторами более широкой публикации ENCODE, опубликованной в журнале Nature, в которой обобщаются усилия последнего цикла финансирования ENCODE. Изюминкой этого исследования является картирование почти одного миллиона элементов в геноме человека, охватывающих 8 процентов генома, которые регулируют гены. То есть они определяют, сколько и в какой ткани организма будет экспрессироваться ген.

«Сложность в организме заключается не в количестве кодирующих белок генов», — сказал Гилберт. «Это в комбинации этих генов. У нас почти такое же количество генов, как у червей и мух, но мы выражаем их в более сложных комбинациях».

Его лаборатория добавляет к картине репликацию — процесс создания ДНК самой копии.

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *