Новый инструмент перехитрить вирус COVID-19 и помочь в разработке вакцины

Новый инструмент перехитрил вирус COVID-19, помогая при разработке вакцины
COVID-3D содержит информацию обо всех белковых структурах, которые совпадают с геномом SARS-CoV-2 (COVID-19), включая все известные генетические мутации и структуру результирующего мутантного белка. Кредит: Pexels

Исследователи из Мельбурна разработали инструмент для отслеживания мутаций, затрудняющих разработку вакцин и лекарств от коронавируса (COVID-19).

Обеспечение эффективности лечения в условиях мутации вируса — огромная проблема для исследователей. Новый мощный инструмент использует геномную и белковую информацию о вирусе и его мутациях, чтобы помочь в разработке лекарств и вакцин.

Доцент Мельбурнского университета Дэвид Ашер и его команда из Института молекулярных наук и биотехнологии Bio21 и Института сердца и диабета Бейкера разработали программный инструмент и библиотеку, получившую название COVID-3-D.

Опубликованный в Nature Genetics документ COVID-3-D содержит информацию обо всех белковых структурах, которые совпадают с геномом SARS-CoV-2 (COVID-19), включая все известные генетические мутации и их структура результирующего мутантного белка.

«Хотя вирус SARS-CoV-2 является относительно новым патогеном, его способность быстро накапливать мутации в своих генах была очевидна с самого начала этой пандемии», — сказал доцент Ашер.

«В контексте разработки и открытия терапевтических лекарств эти мутации и закономерности, по которым они накапливаются в белковых структурах вируса, могут влиять на способность вакцин и лекарств связывать вирус или создавать специфический иммунный ответ против него. Из-за этого ученые должны не только пытаться контролировать вирус, но и перехитрить его, предсказывая, как он будет меняться с течением времени «.

Несколько международных университетов и исследовательских институтов уже используют COVID-3-D при разработке вакцин и лечения.

«В Bio21 это используется в рамках постоянных усилий по пониманию и разработке лекарств для лечения COVID-19», — сказал доцент Ашер.

Для разработки COVID-3-D команда профессора Ашера проанализировала данные секвенирования генома более 120000 образцов SARS-CoV-2 от инфицированных людей во всем мире, в том числе тех, которые уникально влияют на Австралию, для выявления мутаций в каждом из белков вируса. . Они протестировали и проанализировали влияние мутаций на структуру их белков с помощью компьютерного моделирования.

Эти данные были использованы для расчета всех биологических эффектов каждой возможной мутации в геноме. Чтобы помочь исследователям учесть возможные будущие мутации, команда проанализировала мутации в связанных коронавирусах SARS-CoV и Bat RaTG13.

Мутации или изменения в генетическом материале организма — это естественные «ошибки» в процессе репликации клеток. Они могут дать вирусу новые «силы» выживания, инфекционности и вирулентности. К счастью, исследователи обнаружили, что SARS-CoV-2 мутирует медленнее, чем другие вирусы, такие как грипп, и каждый месяц в его геноме происходит около двух новых изменений.

COVID-3-D может помочь исследователям понять, как действуют мутации, и определить более эффективные мишени для вакцин и лекарств.

«Только когда вы знаете, как мутация повлияет на трехмерную форму белка, вы можете предсказать, повлияет ли она на способность вашего препарата связываться», — сказал доцент Ашер.

«По мере того, как мировое научное и медицинское сообщество лучше понимает биологию, лежащую в основе инфекции и заболевания SARS-CoV2, это станет мощным ресурсом для прогнозирования проблем, связанных с мутациями, и для разработки более эффективных методов лечения. COVID-3 -D продолжает обновляться новыми белковыми структурами, мутациями и анализами, чтобы опережать мутации, вызывающие проблемы, и улучшать наше понимание механизмов заболевания SARS-CoV-2. «/P>

Похожие новости

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *